Tyrili er en ideell organisasjon. Det betyr at alt overskudd går tilbake til driften av Tyrili.
Stiftelsens ledelse består av en leder og en nestleder. Anders Dalsaune Jansen er stiftelsens leder. Camilla Fjeld er nestleder.
Stiftelsen har et styre. Her sitter følgende representanter: Sven Petter Omdal (styreleder), Stig Grydeland, Tone Rambraut, Merete Turvoll og Gunnar Engen.
Hver behandlingsenhet er relativt selvstyrende, men behandlingen og hverdagen ser lik ut. Enhetene har ulike funksjoner og målgrupper, og det er enhetsledelsen som har faglig, administrativt og økonomisk ansvar for den enkelte enheten. Enhetsledelsen består av en leder og en eller to nestledere. Se behandlingssteder for ledelse ved hver enkelt enhet.
Det er i underkant av 200 avtaleplasser i stiftelsen. Tyrili har avtale med Helse Sør-Øst, Helse Midt-Norge og Oslo kommune. I tillegg er en del plasser tilknyttet Tyrili Stifinnerteam i Oslo, Bredtveit og Eidsberg fengsel.